Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2V1Q13404 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2V1Q13404 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2V1Q13404 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms