Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROR1Q01973 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROR1Q01973 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROR1Q01973 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ROR1Q01973 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ROR1Q01973 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms