Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK16Q00536 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK16Q00536 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK16Q00536 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK16Q00536 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK16Q00536 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK16Q00536 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK16Q00536 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms