Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-21P61565 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-21P61565 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-21P61565 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVK-21P61565 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-21P61565 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-21P61565 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-21P61565 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVK-21P61565 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-21P61565 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms