Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTP1P59025 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTP1P59025 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTP1P59025 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTP1P59025 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTP1P59025 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTP1P59025 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTP1P59025 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTP1P59025 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTP1P59025 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTP1P59025 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTP1P59025 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RTP1P59025 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTP1P59025 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTP1P59025 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTP1P59025 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTP1P59025 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTP1P59025 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTP1P59025 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTP1P59025 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTP1P59025 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTP1P59025 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTP1P59025 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTP1P59025 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTP1P59025 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTP1P59025 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTP1P59025 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTP1P59025 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTP1P59025 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTP1P59025 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTP1P59025 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTP1P59025 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTP1P59025 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTP1P59025 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTP1P59025 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP1P59025 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP1P59025 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP1P59025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP1P59025 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP1P59025 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTP1P59025 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTP1P59025 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTP1P59025 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTP1P59025 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTP1P59025 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RTP1P59025 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP1P59025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP1P59025 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP1P59025 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP1P59025 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP1P59025 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP1P59025 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP1P59025 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTP1P59025 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTP1P59025 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RTP1P59025 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP1P59025 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP1P59025 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP1P59025 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTP1P59025 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTP1P59025 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTP1P59025 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTP1P59025 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RTP1P59025 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTP1P59025 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTP1P59025 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTP1P59025 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTP1P59025 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTP1P59025 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTP1P59025 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTP1P59025 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTP1P59025 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP1P59025 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP1P59025 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP1P59025 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP1P59025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP1P59025 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTP1P59025 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTP1P59025 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTP1P59025 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTP1P59025 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTP1P59025 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms