Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM11AP58511 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM11AP58511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM11AP58511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM11AP58511 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM11AP58511 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM11AP58511 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms