Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNA4P52798 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNA4P52798 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFNA4P52798 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA4P52798 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA4P52798 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms