Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT8P50990 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT8P50990 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCT8P50990 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCT8P50990 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT8P50990 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT8P50990 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT8P50990 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT8P50990 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT8P50990 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT8P50990 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8P50990 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8P50990 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8P50990 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT8P50990 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT8P50990 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT8P50990 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT8P50990 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT8P50990 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT8P50990 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT8P50990 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT8P50990 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT8P50990 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT8P50990 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT8P50990 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT8P50990 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8P50990 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8P50990 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8P50990 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT8P50990 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT8P50990 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT8P50990 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT8P50990 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT8P50990 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8P50990 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8P50990 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT8P50990 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8P50990 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8P50990 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT8P50990 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8P50990 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8P50990 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8P50990 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8P50990 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT8P50990 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8P50990 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8P50990 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8P50990 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT8P50990 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCT8P50990 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCT8P50990 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8P50990 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8P50990 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT8P50990 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8P50990 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCT8P50990 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8P50990 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCT8P50990 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8P50990 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8P50990 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8P50990 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCT8P50990 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT8P50990 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCT8P50990 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8P50990 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8P50990 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCT8P50990 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8P50990 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCT8P50990 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8P50990 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8P50990 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCT8P50990 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCT8P50990 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8P50990 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8P50990 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8P50990 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCT8P50990 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCT8P50990 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT8P50990 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCT8P50990 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCT8P50990 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT8P50990 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT8P50990 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCT8P50990 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms