Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBP50607 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBP50607 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBP50607 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBP50607 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBP50607 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBP50607 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBP50607 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBP50607 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBP50607 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBP50607 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBP50607 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBP50607 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBP50607 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBP50607 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBP50607 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBP50607 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBP50607 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBP50607 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBP50607 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBP50607 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBP50607 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBP50607 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBP50607 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBP50607 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBP50607 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBP50607 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBP50607 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBP50607 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBP50607 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBP50607 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBP50607 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBP50607 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBP50607 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBP50607 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBP50607 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBP50607 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBP50607 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBP50607 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBP50607 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBP50607 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBP50607 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBP50607 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBP50607 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBP50607 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBP50607 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBP50607 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBP50607 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBP50607 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBP50607 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBP50607 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBP50607 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBP50607 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBP50607 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBP50607 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBP50607 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBP50607 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBP50607 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBP50607 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBP50607 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBP50607 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBP50607 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBP50607 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBP50607 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBP50607 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBP50607 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBP50607 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBP50607 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBP50607 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBP50607 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBP50607 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBP50607 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBP50607 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBP50607 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBP50607 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBP50607 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBP50607 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBP50607 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBP50607 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBP50607 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBP50607 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBP50607 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBP50607 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms