Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARCN1P48444 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARCN1P48444 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARCN1P48444 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARCN1P48444 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARCN1P48444 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARCN1P48444 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1486.6 ms