Protein–RNA interactions for Protein: P48016

ATH1, Vacuolar acid trehalase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATH1P48016 CRR1YLR213C 1269 nt10.58□□□□□ -0.72
ATH1P48016 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt10.58□□□□□ -0.72
ATH1P48016 BOR1YNL275W 1731 nt10.58□□□□□ -0.72
ATH1P48016 DBR1YKL149C 1218 nt10.57□□□□□ -0.72
ATH1P48016 BTS1YPL069C 1008 nt10.57□□□□□ -0.72
ATH1P48016 CLB5YPR120C 1308 nt10.57□□□□□ -0.72
ATH1P48016 YIR016WYIR016W 798 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 BOP3YNL042W 1191 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 YNL228WYNL228W 777 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 TSR3YOR006C 942 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 ATG29YPL166W 642 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 ARR1YPR199C 885 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 UBS1YBR165W 834 nt10.56□□□□□ -0.72
ATH1P48016 YCR087WYCR087W 516 nt10.55□□□□□ -0.72
ATH1P48016 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt10.55□□□□□ -0.72
ATH1P48016 SLM4YBR077C 489 nt10.54□□□□□ -0.72
ATH1P48016 HEM12YDR047W 1089 nt10.53□□□□□ -0.72
ATH1P48016 ENT5YDR153C 1236 nt10.53□□□□□ -0.72
ATH1P48016 RMD5YDR255C 1266 nt10.53□□□□□ -0.72
ATH1P48016 POS5YPL188W 1245 nt10.53□□□□□ -0.72
ATH1P48016 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 BTT1YDR252W 450 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 ELO1YJL196C 933 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 SAM1YLR180W 1149 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 SHE9YDR393W 1371 nt10.52□□□□□ -0.73
ATH1P48016 SNG1YGR197C 1644 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 CHA1YCL064C 1083 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 MRPS8YMR158W 468 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 CSL4YNL232W 879 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 PCL1YNL289W 840 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 IZH4YOL101C 939 nt10.51□□□□□ -0.73
ATH1P48016 YCR049CYCR049C 447 nt10.5□□□□□ -0.73
ATH1P48016 EDC1YGL222C 528 nt10.5□□□□□ -0.73
ATH1P48016 NCE102YPR149W 522 nt10.5□□□□□ -0.73
ATH1P48016 PHO89YBR296C 1725 nt10.5□□□□□ -0.73
ATH1P48016 SHM2YLR058C 1410 nt10.5□□□□□ -0.73
ATH1P48016 YDR010CYDR010C 333 nt10.48□□□□□ -0.73
ATH1P48016 GTR1YML121W 933 nt10.48□□□□□ -0.73
ATH1P48016 MRPL24YMR193W 777 nt10.48□□□□□ -0.73
ATH1P48016 AIM45YPR004C 1035 nt10.48□□□□□ -0.73
ATH1P48016 POP4YBR257W 840 nt10.48□□□□□ -0.73
ATH1P48016 PCD1YLR151C 1023 nt10.47□□□□□ -0.73
ATH1P48016 IDP3YNL009W 1263 nt10.47□□□□□ -0.73
ATH1P48016 DCP1YOL149W 696 nt10.47□□□□□ -0.73
ATH1P48016 YHR145CYHR145C 357 nt10.46□□□□□ -0.73
ATH1P48016 NDL1YLR254C 570 nt10.46□□□□□ -0.73
ATH1P48016 RET2YFR051C 1641 nt10.46□□□□□ -0.74
ATH1P48016 SPR1YOR190W 1338 nt10.45□□□□□ -0.74
ATH1P48016 NCP1YHR042W 2076 nt10.45□□□□□ -0.74
ATH1P48016 BRL1YHR036W 1416 nt10.44□□□□□ -0.74
ATH1P48016 YDR029WYDR029W 315 nt10.44□□□□□ -0.74
ATH1P48016 COS6YGR295C 1146 nt10.44□□□□□ -0.74
ATH1P48016 FRE6YLL051C 2139 nt10.44□□□□□ -0.74
ATH1P48016 MIC10YCL057C-A 294 nt10.44□□□□□ -0.74
ATH1P48016 XDJ1YLR090W 1380 nt10.43□□□□□ -0.74
ATH1P48016 UBC5YDR059C 447 nt10.43□□□□□ -0.74
ATH1P48016 YLR111WYLR111W 333 nt10.43□□□□□ -0.74
ATH1P48016 SGT2YOR007C 1041 nt10.43□□□□□ -0.74
ATH1P48016 PGC1YPL206C 966 nt10.43□□□□□ -0.74
ATH1P48016 MRP20YDR405W 792 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 YDR541CYDR541C 1035 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 SCEIQ0160 708 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 MOB1YIL106W 945 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 MAD2YJL030W 591 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 SSP2YOR242C 1116 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 YPL068CYPL068C 882 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 LSB5YCL034W 1065 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 MCH5YOR306C 1566 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 RSC4YKR008W 1878 nt10.42□□□□□ -0.74
ATH1P48016 BMT6YLR063W 1098 nt10.41□□□□□ -0.74
ATH1P48016 YMR144WYMR144W 1029 nt10.41□□□□□ -0.74
ATH1P48016 ADD66YKL206C 804 nt10.4□□□□□ -0.74
ATH1P48016 ARL3YPL051W 597 nt10.4□□□□□ -0.74
ATH1P48016 LYS4YDR234W 2082 nt10.39□□□□□ -0.75
ATH1P48016 BI2Q0110 1272 nt10.39□□□□□ -0.75
ATH1P48016 ERV29YGR284C 933 nt10.39□□□□□ -0.75
ATH1P48016 SPG5YMR191W 1122 nt10.39□□□□□ -0.75
ATH1P48016 BNA2YJR078W 1362 nt10.39□□□□□ -0.75
ATH1P48016 NPL6YMR091C 1308 nt10.38□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YDL121CYDL121C 450 nt10.38□□□□□ -0.75
ATH1P48016 VHS2YIL135C 1311 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YER138W-AYER138W-A 105 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 NIT1YIL164C 600 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 SAW1YAL027W 786 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 GDH3YAL062W 1374 nt10.37□□□□□ -0.75
ATH1P48016 SEC28YIL076W 891 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 AIM2YAL049C 741 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 TVP38YKR088C 1014 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 CDA2YLR308W 939 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YMR181CYMR181C 465 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 GFD1YMR255W 567 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 END3YNL084C 1050 nt10.36□□□□□ -0.75
ATH1P48016 GCV1YDR019C 1203 nt10.35□□□□□ -0.75
ATH1P48016 SDS22YKL193C 1017 nt10.35□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YET2YMR040W 483 nt10.35□□□□□ -0.75
ATH1P48016 YOL150CYOL150C 312 nt10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms