Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXA7P31268 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXA7P31268 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXA7P31268 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HOXA7P31268 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXA7P31268 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXA7P31268 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXA7P31268 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms