Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCN2P20062 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN2P20062 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN2P20062 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN2P20062 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCN2P20062 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCN2P20062 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCN2P20062 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCN2P20062 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCN2P20062 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN2P20062 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN2P20062 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN2P20062 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN2P20062 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN2P20062 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN2P20062 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN2P20062 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN2P20062 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN2P20062 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN2P20062 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN2P20062 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN2P20062 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN2P20062 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN2P20062 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN2P20062 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCN2P20062 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCN2P20062 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCN2P20062 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCN2P20062 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN2P20062 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN2P20062 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN2P20062 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN2P20062 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN2P20062 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN2P20062 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN2P20062 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN2P20062 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN2P20062 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN2P20062 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN2P20062 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN2P20062 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCN2P20062 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCN2P20062 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCN2P20062 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN2P20062 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCN2P20062 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN2P20062 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN2P20062 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCN2P20062 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCN2P20062 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCN2P20062 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCN2P20062 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCN2P20062 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN2P20062 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN2P20062 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCN2P20062 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCN2P20062 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCN2P20062 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCN2P20062 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCN2P20062 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCN2P20062 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCN2P20062 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCN2P20062 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN2P20062 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN2P20062 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN2P20062 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCN2P20062 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCN2P20062 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCN2P20062 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms