Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT15P19012 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT15P19012 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT15P19012 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT15P19012 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT15P19012 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT15P19012 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT15P19012 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT15P19012 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT15P19012 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT15P19012 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT15P19012 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT15P19012 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT15P19012 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT15P19012 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT15P19012 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT15P19012 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT15P19012 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT15P19012 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT15P19012 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT15P19012 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT15P19012 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT15P19012 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT15P19012 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT15P19012 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT15P19012 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT15P19012 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT15P19012 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT15P19012 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT15P19012 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT15P19012 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT15P19012 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT15P19012 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT15P19012 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT15P19012 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT15P19012 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT15P19012 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT15P19012 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT15P19012 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT15P19012 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT15P19012 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT15P19012 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT15P19012 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT15P19012 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT15P19012 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT15P19012 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT15P19012 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT15P19012 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT15P19012 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT15P19012 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT15P19012 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT15P19012 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT15P19012 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT15P19012 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT15P19012 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT15P19012 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT15P19012 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT15P19012 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT15P19012 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT15P19012 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT15P19012 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT15P19012 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT15P19012 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT15P19012 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT15P19012 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT15P19012 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT15P19012 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT15P19012 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT15P19012 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT15P19012 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT15P19012 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT15P19012 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT15P19012 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT15P19012 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT15P19012 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT15P19012 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT15P19012 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT15P19012 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT15P19012 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT15P19012 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT15P19012 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms