Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBPP18428 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LBPP18428 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBPP18428 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBPP18428 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LBPP18428 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBPP18428 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LBPP18428 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBPP18428 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBPP18428 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBPP18428 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBPP18428 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBPP18428 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBPP18428 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBPP18428 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBPP18428 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBPP18428 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBPP18428 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBPP18428 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBPP18428 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBPP18428 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBPP18428 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBPP18428 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBPP18428 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBPP18428 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBPP18428 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBPP18428 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBPP18428 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBPP18428 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBPP18428 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBPP18428 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBPP18428 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LBPP18428 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBPP18428 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBPP18428 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBPP18428 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LBPP18428 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBPP18428 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBPP18428 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBPP18428 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBPP18428 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBPP18428 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBPP18428 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBPP18428 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBPP18428 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBPP18428 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBPP18428 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBPP18428 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBPP18428 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBPP18428 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBPP18428 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LBPP18428 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LBPP18428 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LBPP18428 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBPP18428 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBPP18428 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LBPP18428 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBPP18428 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBPP18428 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LBPP18428 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBPP18428 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LBPP18428 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LBPP18428 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBPP18428 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBPP18428 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LBPP18428 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LBPP18428 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LBPP18428 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LBPP18428 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LBPP18428 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LBPP18428 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LBPP18428 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LBPP18428 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LBPP18428 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LBPP18428 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LBPP18428 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LBPP18428 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LBPP18428 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LBPP18428 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LBPP18428 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LBPP18428 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LBPP18428 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LBPP18428 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LBPP18428 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LBPP18428 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LBPP18428 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LBPP18428 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LBPP18428 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LBPP18428 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LBPP18428 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LBPP18428 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LBPP18428 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LBPP18428 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LBPP18428 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms