Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP1P17987 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP1P17987 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP1P17987 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP1P17987 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP1P17987 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP1P17987 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP1P17987 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCP1P17987 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP1P17987 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP1P17987 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP1P17987 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP1P17987 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP1P17987 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP1P17987 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP1P17987 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP1P17987 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP1P17987 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP1P17987 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP1P17987 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP1P17987 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP1P17987 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP1P17987 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP1P17987 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCP1P17987 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TCP1P17987 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TCP1P17987 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP1P17987 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP1P17987 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCP1P17987 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCP1P17987 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCP1P17987 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP1P17987 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP1P17987 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP1P17987 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP1P17987 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP1P17987 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP1P17987 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP1P17987 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TCP1P17987 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP1P17987 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP1P17987 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP1P17987 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP1P17987 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP1P17987 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP1P17987 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP1P17987 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP1P17987 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP1P17987 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP1P17987 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP1P17987 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP1P17987 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP1P17987 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP1P17987 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP1P17987 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP1P17987 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCP1P17987 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCP1P17987 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCP1P17987 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP1P17987 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP1P17987 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCP1P17987 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP1P17987 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP1P17987 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP1P17987 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP1P17987 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP1P17987 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP1P17987 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP1P17987 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP1P17987 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCP1P17987 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCP1P17987 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP1P17987 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP1P17987 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP1P17987 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP1P17987 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP1P17987 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP1P17987 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP1P17987 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP1P17987 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP1P17987 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP1P17987 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP1P17987 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCP1P17987 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms