Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNB3P16520 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNB3P16520 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNB3P16520 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNB3P16520 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNB3P16520 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNB3P16520 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB3P16520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB3P16520 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB3P16520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB3P16520 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB3P16520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB3P16520 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB3P16520 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB3P16520 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNB3P16520 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB3P16520 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB3P16520 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB3P16520 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB3P16520 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB3P16520 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB3P16520 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB3P16520 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB3P16520 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB3P16520 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GNB3P16520 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNB3P16520 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNB3P16520 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB3P16520 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNB3P16520 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNB3P16520 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNB3P16520 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNB3P16520 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNB3P16520 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNB3P16520 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNB3P16520 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNB3P16520 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB3P16520 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB3P16520 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB3P16520 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GNB3P16520 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNB3P16520 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNB3P16520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNB3P16520 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB3P16520 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB3P16520 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB3P16520 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB3P16520 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB3P16520 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNB3P16520 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB3P16520 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB3P16520 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB3P16520 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB3P16520 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNB3P16520 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNB3P16520 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNB3P16520 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNB3P16520 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNB3P16520 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNB3P16520 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB3P16520 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB3P16520 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB3P16520 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB3P16520 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB3P16520 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNB3P16520 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB3P16520 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB3P16520 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB3P16520 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB3P16520 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB3P16520 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB3P16520 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB3P16520 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB3P16520 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB3P16520 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB3P16520 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB3P16520 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNB3P16520 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNB3P16520 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNB3P16520 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNB3P16520 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNB3P16520 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms