Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP6V1B1P15313 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1B1P15313 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1B1P15313 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1B1P15313 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP6V1B1P15313 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B1P15313 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms