Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MS4A1P11836 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MS4A1P11836 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MS4A1P11836 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
MS4A1P11836 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MS4A1P11836 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
MS4A1P11836 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MS4A1P11836 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms