Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBBP0CG47 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBBP0CG47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBBP0CG47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBBP0CG47 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBBP0CG47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms