Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROS1P08922 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROS1P08922 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROS1P08922 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ROS1P08922 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ROS1P08922 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROS1P08922 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROS1P08922 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROS1P08922 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROS1P08922 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROS1P08922 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROS1P08922 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROS1P08922 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROS1P08922 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROS1P08922 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROS1P08922 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROS1P08922 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROS1P08922 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROS1P08922 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROS1P08922 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ROS1P08922 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROS1P08922 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROS1P08922 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROS1P08922 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROS1P08922 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROS1P08922 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROS1P08922 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ROS1P08922 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROS1P08922 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROS1P08922 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROS1P08922 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROS1P08922 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROS1P08922 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROS1P08922 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROS1P08922 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROS1P08922 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROS1P08922 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROS1P08922 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROS1P08922 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROS1P08922 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROS1P08922 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ROS1P08922 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROS1P08922 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROS1P08922 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROS1P08922 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROS1P08922 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROS1P08922 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROS1P08922 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROS1P08922 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROS1P08922 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ROS1P08922 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROS1P08922 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROS1P08922 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROS1P08922 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROS1P08922 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ROS1P08922 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROS1P08922 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROS1P08922 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROS1P08922 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ROS1P08922 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ROS1P08922 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROS1P08922 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROS1P08922 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROS1P08922 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROS1P08922 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROS1P08922 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ROS1P08922 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ROS1P08922 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ROS1P08922 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROS1P08922 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROS1P08922 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROS1P08922 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROS1P08922 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROS1P08922 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROS1P08922 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROS1P08922 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROS1P08922 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms