Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP3P08254 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMP3P08254 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP3P08254 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP3P08254 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP3P08254 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP3P08254 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP3P08254 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP3P08254 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP3P08254 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMP3P08254 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP3P08254 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP3P08254 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP3P08254 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP3P08254 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP3P08254 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP3P08254 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMP3P08254 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MMP3P08254 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MMP3P08254 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP3P08254 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP3P08254 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP3P08254 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP3P08254 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP3P08254 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP3P08254 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP3P08254 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP3P08254 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP3P08254 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP3P08254 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MMP3P08254 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP3P08254 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP3P08254 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP3P08254 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP3P08254 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP3P08254 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP3P08254 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP3P08254 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP3P08254 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP3P08254 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP3P08254 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MMP3P08254 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP3P08254 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP3P08254 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMP3P08254 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP3P08254 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP3P08254 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MMP3P08254 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP3P08254 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP3P08254 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MMP3P08254 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP3P08254 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP3P08254 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP3P08254 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP3P08254 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP3P08254 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MMP3P08254 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP3P08254 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP3P08254 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP3P08254 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MMP3P08254 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MMP3P08254 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MMP3P08254 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP3P08254 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP3P08254 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP3P08254 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP3P08254 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP3P08254 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP3P08254 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP3P08254 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP3P08254 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP3P08254 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP3P08254 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP3P08254 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP3P08254 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP3P08254 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP3P08254 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP3P08254 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP3P08254 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MMP3P08254 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP3P08254 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP3P08254 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP3P08254 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP3P08254 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP3P08254 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms