Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNB1P01574 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNB1P01574 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNB1P01574 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNB1P01574 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNB1P01574 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFNB1P01574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms