Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAPBO95292 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAPBO95292 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAPBO95292 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAPBO95292 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAPBO95292 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAPBO95292 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAPBO95292 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VAPBO95292 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAPBO95292 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAPBO95292 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAPBO95292 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAPBO95292 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAPBO95292 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAPBO95292 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAPBO95292 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAPBO95292 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAPBO95292 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAPBO95292 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAPBO95292 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAPBO95292 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAPBO95292 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAPBO95292 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAPBO95292 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAPBO95292 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAPBO95292 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAPBO95292 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAPBO95292 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAPBO95292 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAPBO95292 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAPBO95292 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAPBO95292 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAPBO95292 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAPBO95292 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAPBO95292 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAPBO95292 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAPBO95292 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAPBO95292 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAPBO95292 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAPBO95292 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VAPBO95292 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAPBO95292 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAPBO95292 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAPBO95292 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAPBO95292 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAPBO95292 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAPBO95292 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAPBO95292 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAPBO95292 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAPBO95292 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAPBO95292 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAPBO95292 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAPBO95292 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAPBO95292 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAPBO95292 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAPBO95292 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAPBO95292 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAPBO95292 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAPBO95292 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAPBO95292 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAPBO95292 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAPBO95292 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAPBO95292 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAPBO95292 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAPBO95292 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAPBO95292 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAPBO95292 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAPBO95292 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAPBO95292 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAPBO95292 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAPBO95292 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAPBO95292 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAPBO95292 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAPBO95292 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAPBO95292 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAPBO95292 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAPBO95292 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAPBO95292 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAPBO95292 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAPBO95292 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAPBO95292 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAPBO95292 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAPBO95292 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAPBO95292 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAPBO95292 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAPBO95292 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAPBO95292 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAPBO95292 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAPBO95292 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAPBO95292 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms