Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LETM1O95202 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LETM1O95202 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LETM1O95202 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LETM1O95202 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LETM1O95202 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LETM1O95202 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LETM1O95202 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LETM1O95202 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LETM1O95202 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LETM1O95202 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LETM1O95202 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LETM1O95202 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LETM1O95202 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LETM1O95202 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LETM1O95202 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LETM1O95202 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LETM1O95202 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LETM1O95202 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LETM1O95202 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LETM1O95202 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LETM1O95202 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LETM1O95202 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LETM1O95202 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LETM1O95202 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LETM1O95202 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LETM1O95202 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LETM1O95202 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LETM1O95202 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LETM1O95202 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LETM1O95202 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LETM1O95202 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LETM1O95202 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LETM1O95202 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LETM1O95202 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LETM1O95202 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LETM1O95202 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LETM1O95202 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LETM1O95202 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LETM1O95202 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LETM1O95202 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LETM1O95202 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LETM1O95202 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LETM1O95202 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LETM1O95202 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LETM1O95202 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LETM1O95202 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LETM1O95202 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LETM1O95202 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LETM1O95202 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LETM1O95202 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LETM1O95202 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LETM1O95202 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LETM1O95202 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LETM1O95202 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LETM1O95202 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LETM1O95202 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LETM1O95202 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LETM1O95202 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LETM1O95202 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LETM1O95202 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LETM1O95202 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LETM1O95202 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LETM1O95202 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LETM1O95202 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LETM1O95202 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LETM1O95202 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LETM1O95202 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LETM1O95202 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LETM1O95202 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LETM1O95202 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LETM1O95202 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LETM1O95202 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LETM1O95202 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LETM1O95202 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LETM1O95202 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LETM1O95202 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LETM1O95202 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LETM1O95202 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LETM1O95202 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LETM1O95202 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LETM1O95202 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LETM1O95202 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LETM1O95202 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LETM1O95202 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LETM1O95202 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LETM1O95202 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LETM1O95202 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LETM1O95202 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LETM1O95202 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LETM1O95202 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LETM1O95202 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LETM1O95202 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LETM1O95202 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LETM1O95202 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms