Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSO75390 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSO75390 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSO75390 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSO75390 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSO75390 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSO75390 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSO75390 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSO75390 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSO75390 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSO75390 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSO75390 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSO75390 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSO75390 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSO75390 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSO75390 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSO75390 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSO75390 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSO75390 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSO75390 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSO75390 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSO75390 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSO75390 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSO75390 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSO75390 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSO75390 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSO75390 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSO75390 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSO75390 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSO75390 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSO75390 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSO75390 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSO75390 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSO75390 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSO75390 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSO75390 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSO75390 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSO75390 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSO75390 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSO75390 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSO75390 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSO75390 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSO75390 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSO75390 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSO75390 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSO75390 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSO75390 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSO75390 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSO75390 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSO75390 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSO75390 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSO75390 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSO75390 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSO75390 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSO75390 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSO75390 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSO75390 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSO75390 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSO75390 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSO75390 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSO75390 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSO75390 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSO75390 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSO75390 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSO75390 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSO75390 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSO75390 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSO75390 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSO75390 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSO75390 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSO75390 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSO75390 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSO75390 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSO75390 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSO75390 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSO75390 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSO75390 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSO75390 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSO75390 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSO75390 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSO75390 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSO75390 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSO75390 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSO75390 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms