Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DTNBO60941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DTNBO60941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DTNBO60941 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DTNBO60941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DTNBO60941 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DTNBO60941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
DTNBO60941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DTNBO60941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DTNBO60941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DTNBO60941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DTNBO60941 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DTNBO60941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DTNBO60941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
DTNBO60941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DTNBO60941 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DTNBO60941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DTNBO60941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DTNBO60941 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DTNBO60941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DTNBO60941 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DTNBO60941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DTNBO60941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DTNBO60941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DTNBO60941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DTNBO60941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DTNBO60941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DTNBO60941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DTNBO60941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DTNBO60941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DTNBO60941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DTNBO60941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DTNBO60941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DTNBO60941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DTNBO60941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DTNBO60941 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTNBO60941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DTNBO60941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DTNBO60941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DTNBO60941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DTNBO60941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
DTNBO60941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DTNBO60941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DTNBO60941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DTNBO60941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DTNBO60941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DTNBO60941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DTNBO60941 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DTNBO60941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DTNBO60941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DTNBO60941 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DTNBO60941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
DTNBO60941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DTNBO60941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DTNBO60941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DTNBO60941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DTNBO60941 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DTNBO60941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DTNBO60941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DTNBO60941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DTNBO60941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DTNBO60941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DTNBO60941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DTNBO60941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DTNBO60941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DTNBO60941 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DTNBO60941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DTNBO60941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DTNBO60941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DTNBO60941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DTNBO60941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DTNBO60941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DTNBO60941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DTNBO60941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DTNBO60941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DTNBO60941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DTNBO60941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DTNBO60941 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms