Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMDSO60547 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMDSO60547 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMDSO60547 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMDSO60547 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMDSO60547 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMDSO60547 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMDSO60547 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMDSO60547 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMDSO60547 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMDSO60547 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMDSO60547 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMDSO60547 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMDSO60547 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMDSO60547 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMDSO60547 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMDSO60547 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMDSO60547 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMDSO60547 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMDSO60547 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMDSO60547 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMDSO60547 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMDSO60547 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMDSO60547 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMDSO60547 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMDSO60547 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GMDSO60547 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMDSO60547 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMDSO60547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMDSO60547 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMDSO60547 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMDSO60547 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GMDSO60547 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMDSO60547 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMDSO60547 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMDSO60547 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMDSO60547 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMDSO60547 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMDSO60547 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMDSO60547 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMDSO60547 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMDSO60547 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMDSO60547 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMDSO60547 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMDSO60547 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMDSO60547 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMDSO60547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GMDSO60547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GMDSO60547 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMDSO60547 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMDSO60547 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMDSO60547 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GMDSO60547 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMDSO60547 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GMDSO60547 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMDSO60547 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMDSO60547 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMDSO60547 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GMDSO60547 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GMDSO60547 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GMDSO60547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms