Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFSF14O43557 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF14O43557 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF14O43557 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFSF14O43557 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF14O43557 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF14O43557 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms