Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAMP3O14828 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAMP3O14828 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAMP3O14828 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAMP3O14828 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAMP3O14828 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAMP3O14828 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAMP3O14828 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAMP3O14828 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms