Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBFD1O14562 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBFD1O14562 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBFD1O14562 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBFD1O14562 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBFD1O14562 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBFD1O14562 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBFD1O14562 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBFD1O14562 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBFD1O14562 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBFD1O14562 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms