Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KT08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KT08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KT08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KT08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KT08 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KT08 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KT08 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3KT08 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KT08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KT08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KT08 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3KT08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KT08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KT08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KT08 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3KT08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KT08 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3KT08 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KT08 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3KT08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KT08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KT08 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KT08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KT08 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KT08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KT08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KT08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KT08 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KT08 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KT08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KT08 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KT08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KT08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KT08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KT08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KT08 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KT08 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3KT08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KT08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KT08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3KT08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KT08 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KT08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3KT08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KT08 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KT08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
J3KT08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KT08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KT08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3KT08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KT08 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KT08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KT08 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KT08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KT08 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KT08 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KT08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KT08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KT08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KT08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KT08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KT08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KT08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KT08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KT08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3KT08 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KT08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms