Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms