Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
E9PCH4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
E9PCH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
E9PCH4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
E9PCH4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
E9PCH4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
E9PCH4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
E9PCH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
E9PCH4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
E9PCH4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
E9PCH4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
E9PCH4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
E9PCH4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
E9PCH4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
E9PCH4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
E9PCH4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
E9PCH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
E9PCH4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
E9PCH4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
E9PCH4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
E9PCH4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
E9PCH4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
E9PCH4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
E9PCH4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
E9PCH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
E9PCH4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
E9PCH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
E9PCH4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
E9PCH4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
E9PCH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
E9PCH4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
E9PCH4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
E9PCH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
E9PCH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
E9PCH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
E9PCH4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
E9PCH4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
E9PCH4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
E9PCH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
E9PCH4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
E9PCH4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
E9PCH4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
E9PCH4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
E9PCH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
E9PCH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
E9PCH4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
E9PCH4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
E9PCH4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
E9PCH4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
E9PCH4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
E9PCH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
E9PCH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
E9PCH4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
E9PCH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
E9PCH4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
E9PCH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms