Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms