Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HNRNPCL3B7ZW38 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HNRNPCL3B7ZW38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HNRNPCL3B7ZW38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HNRNPCL3B7ZW38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms