Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRDCB7Z8K6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDCB7Z8K6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDCB7Z8K6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDCB7Z8K6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRDCB7Z8K6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRDCB7Z8K6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms