Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C2CD4DB7Z1M9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C2CD4DB7Z1M9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C2CD4DB7Z1M9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2CD4DB7Z1M9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C2CD4DB7Z1M9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2CD4DB7Z1M9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C2CD4DB7Z1M9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms