Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYCE1LA8MT33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE1LA8MT33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE1LA8MT33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE1LA8MT33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE1LA8MT33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE1LA8MT33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms