Protein–RNA interactions for Protein: A6NFC5

TMEM235, Transmembrane protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM235A6NFC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM235A6NFC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM235A6NFC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM235A6NFC5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM235A6NFC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM235A6NFC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM235A6NFC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms