Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA6L4A6NEF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L4A6NEF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L4A6NEF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GOLGA6L4A6NEF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GOLGA6L4A6NEF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms