Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNDIG1LA6NDD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNDIG1LA6NDD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNDIG1LA6NDD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNDIG1LA6NDD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms