Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	PET130	YJL023C	1044 nt		0.06	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YJL119C	YJL119C	324 nt		0.06	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	HUG1	YML058W-A	207 nt		0.06	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	ASG1	YIL130W	2895 nt		0.06	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	COX1	Q0045	1605 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SEC63	YOR254C	1992 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	CTF18	YMR078C	2226 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	LSM6	YDR378C	261 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	TEN1	YLR010C	483 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SPT14	YPL175W	1359 nt		0.05	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.04	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YDL211C	YDL211C	1119 nt		0.04	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SRN2	YLR119W	642 nt		0.04	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	PAF1	YBR279W	1338 nt		0.04	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	GEA2	YEL022W	4380 nt		0.04	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	RED1	YLR263W	2484 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YGR290W	YGR290W	444 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SPO13	YHR014W	876 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SDL1	YIL167W	633 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YJL022W	YJL022W	309 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YBR277C	YBR277C	402 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	DPB3	YBR278W	606 nt		0.03	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	NUP188	YML103C	4968 nt		0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	LTE1	YAL024C	4308 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	PRS3	YHL011C	963 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SPC2	YML055W	537 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	GSH2	YOL049W	1476 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	FUS1	YCL027W	1539 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YCK3	YER123W	1575 nt		0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MUK1	YPL070W	1839 nt		0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MEI4	YER044C-A	1227 nt		0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MSL1	YIR009W	336 nt		0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YOL114C	YOL114C	609 nt		0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	AFR1	YDR085C	1863 nt		0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SMB1	YER029C	591 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SAE2	YGL175C	1038 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SLX9	YGR081C	633 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	VPS55	YJR044C	423 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SFT1	YKL006C-A	294 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	OMA1	YKR087C	1038 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SMD3	YLR147C	306 nt		0	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	CLB5	YPR120C	1308 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	snR76	snR76	109 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	PRP38	YGR075C	729 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	RSM27	YGR215W	333 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	PAU12	YGR294W	363 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MRPL49	YJL096W	486 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	PAI3	YMR174C	207 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MCT1	YOR221C	1083 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	RLM1	YPL089C	2031 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MNE1	YOR350C	1992 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	BEM3	YPL115C	3387 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YLL007C	YLL007C	1998 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MZM1	YDR493W	372 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	SDT1	YGL224C	843 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	LCL2	YLR104W	396 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	MSS2	YDL107W	1056 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YOL014W	YOL014W	375 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	TIM18	YOR297C	579 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	PAN2	YGL094C	3348 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	STE5	YDR103W	2754 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	YSP1	YHR155W	3687 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
DDR2	P89113	IQG1	YPL242C	4488 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YPR148C	YPR148C	1308 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YIL161W	YIL161W	708 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YLL020C	YLL020C	306 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YMR324C	YMR324C	243 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YNL010W	YNL010W	726 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	snR13	snR13	124 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	SYO1	YDL063C	1863 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	RTG3	YBL103C	1461 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YSW1	YBR148W	1830 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	MAM1	YER106W	909 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YLR444C	YLR444C	303 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	ERD2	YBL040C	660 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YBL083C	YBL083C	426 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	TOA1	YOR194C	861 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	UTP13	YLR222C	2454 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	SWT1	YOR166C	1377 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	NOP53	YPL146C	1368 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	TSA2	YDR453C	591 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	RGI2	YIL057C	495 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	UPS2	YLR168C	693 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	CSI2	YOL007C	1026 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	PRK1	YIL095W	2433 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YFR054C	YFR054C	579 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	COF1	YLL050C	432 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	RPL37A	YLR185W	267 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	VPS71	YML041C	843 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	NGG1	YDR176W	2109 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	HUL5	YGL141W	2733 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	UBC7	YMR022W	498 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	PIN3	YPR154W	648 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	APC2	YLR127C	2562 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
DDR2	P89113	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		-0.09	□□□□□ -2.42

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