Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB2P55268 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB2P55268 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms