RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517697.5

CA3-AS1-201, CA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CA3-AS1, Length 559 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA3-AS1-201ENST00000517697 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.28■■■■■ 5.32
CA3-AS1-201ENST00000517697 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.17■■■■■ 4.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCC9O60706 1549 aa42.54■■■■■ 4.4
CA3-AS1-201ENST00000517697 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
CA3-AS1-201ENST00000517697 NACADO15069 1562 aa40.65■■■■■ 4.1
CA3-AS1-201ENST00000517697 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.33■■■■■ 4.05
CA3-AS1-201ENST00000517697 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.25■■■■■ 4.03
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
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CA3-AS1-201ENST00000517697 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.97■■■■□ 3.99
CA3-AS1-201ENST00000517697 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.67■■■■□ 3.94
CA3-AS1-201ENST00000517697 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.93
CA3-AS1-201ENST00000517697 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.53■■■■□ 3.92
CA3-AS1-201ENST00000517697 SCRIBQ14160 1630 aa39.25■■■■□ 3.87
CA3-AS1-201ENST00000517697 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.17■■■■□ 3.86
CA3-AS1-201ENST00000517697 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CA3-AS1-201ENST00000517697 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.53■■■■□ 3.76
CA3-AS1-201ENST00000517697 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.29■■■■□ 3.72
CA3-AS1-201ENST00000517697 SMARCA4P51532 1647 aa37.57■■■■□ 3.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 NCAPD3P42695 1498 aa37.52■■■■□ 3.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.46■■■■□ 3.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 SMARCA2P51531 1590 aa37.37■■■■□ 3.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 HMGXB3Q12766 1538 aa37.31■■■■□ 3.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.27■■■■□ 3.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.21■■■■□ 3.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CA3-AS1-201ENST00000517697 WIZO95785 1651 aa36.83■■■■□ 3.49
CA3-AS1-201ENST00000517697 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CA3-AS1-201ENST00000517697 NESP48681 1621 aa36.74■■■■□ 3.47
CA3-AS1-201ENST00000517697 ERCC6Q03468 1493 aa36.63■■■■□ 3.45
CA3-AS1-201ENST00000517697 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.59■■■■□ 3.45
CA3-AS1-201ENST00000517697 CUX2O14529 1486 aa36.52■■■■□ 3.44
CA3-AS1-201ENST00000517697 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CA3-AS1-201ENST00000517697 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.36■■■■□ 3.41
CA3-AS1-201ENST00000517697 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CA3-AS1-201ENST00000517697 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.33■■■■□ 3.41
CA3-AS1-201ENST00000517697 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.29■■■■□ 3.4
CA3-AS1-201ENST00000517697 CFTRP13569 1480 aa36.09■■■■□ 3.37
CA3-AS1-201ENST00000517697 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.99■■■■□ 3.35
CA3-AS1-201ENST00000517697 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.97■■■■□ 3.35
CA3-AS1-201ENST00000517697 WDR62O43379 1518 aa35.94■■■■□ 3.34
CA3-AS1-201ENST00000517697 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.93■■■■□ 3.34
CA3-AS1-201ENST00000517697 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.92■■■■□ 3.34
CA3-AS1-201ENST00000517697 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.9■■■■□ 3.34
CA3-AS1-201ENST00000517697 PRDM2Q13029 1718 aa35.84■■■■□ 3.33
CA3-AS1-201ENST00000517697 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CA3-AS1-201ENST00000517697 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CA3-AS1-201ENST00000517697 TOPBP1Q92547 1522 aa35.34■■■■□ 3.25
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCC8Q09428 1581 aa35.27■■■■□ 3.24
CA3-AS1-201ENST00000517697 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.26■■■■□ 3.24
CA3-AS1-201ENST00000517697 IFT140Q96RY7 1462 aa35.2■■■■□ 3.23
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
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CA3-AS1-201ENST00000517697 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.84■■■■□ 3.17
CA3-AS1-201ENST00000517697 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
CA3-AS1-201ENST00000517697 OSCARQ8IYS5 282 aa34.83■■■■□ 3.17
CA3-AS1-201ENST00000517697 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.82■■■■□ 3.16
CA3-AS1-201ENST00000517697 SOGA1O94964 1423 aa34.8■■■■□ 3.16
CA3-AS1-201ENST00000517697 WDR97A6NE52 1622 aa34.73■■■■□ 3.15
CA3-AS1-201ENST00000517697 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.66■■■■□ 3.14
CA3-AS1-201ENST00000517697 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.65■■■■□ 3.14
CA3-AS1-201ENST00000517697 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CA3-AS1-201ENST00000517697 TOP2BQ02880 1626 aa34.64■■■■□ 3.14
CA3-AS1-201ENST00000517697 CHD1O14646 1710 aa34.62■■■■□ 3.13
CA3-AS1-201ENST00000517697 SYNJ1O43426 1573 aa34.62■■■■□ 3.13
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.51■■■■□ 3.12
CA3-AS1-201ENST00000517697 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.49■■■■□ 3.11
CA3-AS1-201ENST00000517697 GRIN2BQ13224 1484 aa34.47■■■■□ 3.11
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.45■■■■□ 3.11
CA3-AS1-201ENST00000517697 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
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CA3-AS1-201ENST00000517697 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.44■■■■□ 3.1
CA3-AS1-201ENST00000517697 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.44■■■■□ 3.1
CA3-AS1-201ENST00000517697 PBRM1Q86U86 1689 aa34.43■■■■□ 3.1
CA3-AS1-201ENST00000517697 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.4■■■■□ 3.1
CA3-AS1-201ENST00000517697 TRIM41Q8WV44 630 aa34.38■■■■□ 3.09
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARHGEF11O15085 1522 aa34.37■■■■□ 3.09
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CA3-AS1-201ENST00000517697 SYNJ2O15056 1496 aa34.32■■■■□ 3.08
CA3-AS1-201ENST00000517697 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.27■■■■□ 3.08
CA3-AS1-201ENST00000517697 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
CA3-AS1-201ENST00000517697 ADAMTS12P58397 1594 aa34.13■■■■□ 3.05
CA3-AS1-201ENST00000517697 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.09■■■■□ 3.05
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARAP1Q96P48 1450 aa34.08■■■■□ 3.05
CA3-AS1-201ENST00000517697 GRIN2AQ12879 1464 aa34.05■■■■□ 3.04
CA3-AS1-201ENST00000517697 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.99■■■■□ 3.03
CA3-AS1-201ENST00000517697 NUP160Q12769 1436 aa33.96■■■■□ 3.03
CA3-AS1-201ENST00000517697 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.95■■■■□ 3.03
CA3-AS1-201ENST00000517697 KIF27Q86VH2 1401 aa33.94■■■■□ 3.02
CA3-AS1-201ENST00000517697 CEP170Q5SW79 1584 aa33.94■■■■□ 3.02
CA3-AS1-201ENST00000517697 CUL7Q14999 1698 aa33.8■■■■□ 3
CA3-AS1-201ENST00000517697 SHROOM2Q13796 1616 aa33.8■■■■□ 3
CA3-AS1-201ENST00000517697 IGF1RP08069 1367 aa33.75■■■□□ 2.99
CA3-AS1-201ENST00000517697 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.74■■■□□ 2.99
CA3-AS1-201ENST00000517697 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.64■■■□□ 2.98
CA3-AS1-201ENST00000517697 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.57■■■□□ 2.96
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