Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEFLP07196 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEFLP07196 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEFLP07196 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEFLP07196 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEFLP07196 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEFLP07196 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms