Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGM1P36871 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGM1P36871 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGM1P36871 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGM1P36871 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGM1P36871 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGM1P36871 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGM1P36871 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGM1P36871 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGM1P36871 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGM1P36871 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms