Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNE2O96020 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNE2O96020 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms