Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGGBP1Q9UFW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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