Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHLDB3Q6NSJ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms